Файлы с расширением .pkg, которые лежат в res\packages, являются обычными zip.
Для модификации переименовываем в .zip, после модификации обратно в .pkg. Ну, а самый простой способ:
Правой кнопкой по файлу и "Открыть с помощью" -> "Выбор программы из списка установленных программ" -> выбираем архиватор и ставим галку "Использовать выбранную программу для всех файлов такого типа"
И заменяем файлы из окна архиватора.